中国科学家AI蛋白质预测重大突破!

发布时间:2025-01-18

近日,中南大学李敏教授团队提出了一种名为DPFunc的基于深度学习的蛋白质功能预测方法,通过引入结构域引导的结构信息,显著提升了蛋白质功能预测的准确性和可解释性,为蛋白质功能预测这一复杂难题提供了创新解决方案。

DPFunc由残基级特征学习模块、蛋白质水平特征学习模块和蛋白质功能预测模块构成。团队通过将大规模数据集按时间戳划分为训练集、验证集和测试集,并采用标准化处理,对比多种现有方法评估其性能。结果显示,DPFunc 在多个指标上表现优异,尤其在处理具有低序列同一性、高IC值的信息性GO项及具有更深节点的特定GO项等方面优势明显,还可有效检测关键残基和酶活性位点,但在无序区域寻找活性位点仍是未来待探索的挑战。

DPFunc 为大规模蛋白质功能预测提供有效工具,可识别蛋白质结构中的关键区域、潜在结构基序和关键残基,在稀有功能、特定功能和与已知蛋白质序列相似性较低的困难蛋白质方面也优于其他方法。但蛋白质功能动态预测仍是未来挑战。

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-024-54816-8

来源:ScienceAI